در گیاهان 3 نوع مقاومت مهم داریم:

1.مقاومت غیر میزبانی Non host resistance : میزبان ، خاص عامل بیمارگر نیست.

2.مقاومت ژنتیکی : گیاهی می تواند به پاتوژنی آلوده شود ولی رقم خاصی از این گیاه از لحاظ ژنتیکی،ژنهایی دارد که مسئول ایجاد مقاومت هستند.توان ایجاد بیماری در میزبان وجود دارد ولی بروز ژن های مقاومت باعث عدم بروز بیماری می شود و در ارقام دیگر که ژن های مقاوم وجود ندارند،

بیماری می تواند ایجاد شود.مقاومت ژنتیکی خود 2 نوع است .

الف) مقاومت ژنتیکی عمودی Vertical resistance

ب) مقاومت ژنتیکی افقی Horizontal Resistance

Horizontal Resistance .3 مقاومت القایی Induced Resistance مقاومت عمودی : مقاومت تک ژنی است،یعنی یک ژن(غالب)مسئول بروزمقاومت است،در این مقاومت ژن در برابر همه نژاد های موجود پاتوژن مقاومت نشان می دهد.

مقاومت افقی : هیچ ژنی به تنهایی قادر به ایجاد مقاومت نیست،مقاومت نسبی است و به تعداد ژن های مسئول بروز مقاومت بستگی دارد،هرچه تعداد ژن ها بیشتر باشد،میزان مقاومت بیشتر خواهد بود.
در مقاومت افقی بالاخره مقداری بیماری به وجود می آید ( برای مثال ایجاد لکه ) ولی عملکرد خیلی کاهش نمی یابد.
استفاده از ارقام مقاوم با منقاومت عمودی: چون پاتوژن فقط یک بار تولید مثل می کند،اگر رقمی به کار ببریم که نسبت به پاتوژن ها مقاوم باشد نباید انتظار بروز بیماری را داشته باشیم.ولی این مقاومت در اثر وجود نژادهای جدید پاتوژن شکسته می شود.